二房追認十一世的吳東玄祖為本房太公,今已傳至廿七世或廿八世。二房人丁分布在衙前圍、沙埔、石鼓壟和將軍澳,衙前圍二房人丁單薄,戰後在衙前圍居住的只有3家人。將軍澳吳氏是一條大分支,約於清乾隆中業開基,跟衙前圍吳氏沒有來往。祖墳位置不詳,族人只拜祭總太公吳成達祖。二房沒有嘗產和祖堂,跟長房、三房和四房共管吳氏宗祠和至德公立學校,在吳成達祖有一位司理代表。