雅麗氏醫院及西醫書院的主導者何啟是當時香港的華人領袖，亦是孫先生的醫學和政治啟蒙老師。何啟身兼醫生、大律師、商人及定例局(立法局)華人議員，當時在校內擔任法醫學及生理學教授，經常論政提倡中國西化改革。而另一位與孫先生關係密切的老師是教務長兼外科教授康德黎，兩人在醫學、日後行醫及政治活動上有緊密關係，後來孫先生於1896年在倫敦被大清使館人員非法禁錮，便是靠身在英國的康德黎成功營救。

西醫書院於1912年併入港大成為該校醫學院，而雅麗氏醫院則於1921年遷到般含道新院舍，後來與另外兩間醫院合併成今日的雅麗氏何妙齡那打素醫院。

1892年，孫先生以優異成績畢業，成為第一屆畢業生及獲得醫生執照，當年的畢業禮於第一代大會堂舉行，由港督羅便臣親授畢業證書。五年的醫學院生涯不單讓孫先生取得行醫資格，更讓他結識各方人馬議政論事，孕育出改革思想。